基于转录组和WGCNA筛选大葱雄性不育相关基因OA北大核心CSTPCD
Screening Genes Related to Male Sterile in Welsh Onion(Allium fistulosum L.)Based on Transcriptomic Profiling and WGCNA
[目的]挖掘大葱雄性不育相关的特异性模块并筛选核心基因,为后续深入解析大葱雄性不育分子机制提供理论依据.[方法]以大葱可育株MF和不育株MS不同发育时期的花蕾为研究对象,基于转录组测序和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),鉴定与大葱雄性不育相关的特异性模块,筛选核心基因.[结果]通过WGCNA分析,将 8320 个基因划分为 18 个共表达模块,获得 3 …查看全部>>
[Objective]The aim of this study is to identify the co-expression modules of male sterile Welsh onion(Allium fistulosum L.)and to screen key hub genes,so as to provide deeper insights into the molecular mechanisms of male sterile in the Welsh onion.[Method]Twenty-four cDNA libraries were constructed and sequenced for different development stages of flower buds from the male-sterile(MS)plants and male-fertile(MF)plants.Then weighted gene co-expression network…查看全部>>
岳丽昕;王清华;刘泽洲;孔素萍;高莉敏
山东省农业科学院蔬菜研究所 国家蔬菜改良中心山东分中心 山东省设施蔬菜生物学重点实验室 农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站(山东),济南 250100山东省农业科学院蔬菜研究所 国家蔬菜改良中心山东分中心 山东省设施蔬菜生物学重点实验室 农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站(山东),济南 250100山东省农业科学院蔬菜研究所 国家蔬菜改良中心山东分中心 山东省设施蔬菜生物学重点实验室 农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站(山东),济南 250100山东省农业科学院蔬菜研究所 国家蔬菜改良中心山东分中心 山东省设施蔬菜生物学重点实验室 农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站(山东),济南 250100山东省农业科学院蔬菜研究所 国家蔬菜改良中心山东分中心 山东省设施蔬菜生物学重点实验室 农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站(山东),济南 250100
大葱雄性不育加权基因共表达网络分析转录组测序核心基因
Welsh onionmale sterileweighted gene co-expression network analysisRNA-Seqhub gene
《生物技术通报》 2024 (9)
212-224,13
山东省重点研发计划(2023TZXD071),山东省蔬菜产业技术体系(SDAIT-05),山东省农业科学院农业科技创新工程(CXGC2024F08,CXG2023A07)
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