设计与筛选靶向PI3Kα的去氢骆驼蓬碱衍生物及其分子动力学验证OACSTPCD
Design and screening of dehydrogenated harmine derivatives targeting PI3Kα and their molecular dynamics validation
以PI3Kα作为靶蛋白,采用计算机辅助设计的方法优化去氢骆驼蓬碱结构,获得与靶蛋白结合力较高的化合物.在此基础上,利用分子对接,三维定量构效关系(3D-QSAR)和分子动力学技术验证了修饰化合物与靶蛋白的结合能力和稳定性.最后筛选出与靶标具有更好结合力的潜在去氢骆驼蓬碱结构衍生物.使用ACD/Percepta软件对去氢骆驼蓬碱的母核进行结构修饰,获得136 745个化合物的化合物库.通过Schrödinger软件从化合物库中依据MM/GBSA(分…查看全部>>
Using PI3Kα as the target protein,a computer-aided design method is used to optimize the structure of harmine and obtain compounds with high binding power to the target protein.On this basis,molecular docking,three-dimensional quantitative structure-activity relationship(3D-QSAR)and molecular dynamics techniques are used to verify the binding ability and stability of the modified compound to the target protein.Finally,potential harmine derivatives with bette…查看全部>>
王昭志;贺宏吉;仲春红;卡迪热娅·艾克拉木;白静雅;王梅
新疆医科大学 药学院,乌鲁木齐 830011新疆医科大学 药学院,乌鲁木齐 830011新疆医科大学 药学院,乌鲁木齐 830011新疆医科大学 药学院,乌鲁木齐 830011新疆医科大学 药学院,乌鲁木齐 830011新疆医科大学 药学院,乌鲁木齐 830011
药学
去氢骆驼蓬碱虚拟筛选3D-QSAR分子动力学ADMET
HarmineVirtual screening3D-QSARMolecular dynamicsADMET
《生物信息学》 2024 (3)
204-216,13
国家自然科学基金项目((No.81760637).
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