基于TransformerMGI的microRNA靶向基因预测OACSTPCD
MicroRNA-targeted gene prediction based on TransformerMGI
生物小分子microRNA可以对基因表达进行正向或负向调控,研究microRNA与基因之间的关系对于机体稳态的维持和疾病治疗都有着重要意义.利用深度学习方法对microRNA和基因靶向关系进行预测,提出了TransformerMGI模型.在特征工程阶段,针对生物序列潜在信息难以准确地提取这一问题,TransformerMGI模型分别采用了基于图卷积神经网络的GP-GCN方法和DNA2Vec模型对microRNA和基因数据的潜在信息进行提取,得到了…查看全部>>
Biological small molecules such as microRNAs play an important role in biological processes and can positively or negatively regulate gene expression.Studying the relationship between microRNAs and genes is of great significance for the maintenance of homeostasis and the treatment of diseases.In this paper,the deep learning method is used to predict the relationship between microRNA and gene targeting,and the TransformerMGI model is proposed.In the feature e…查看全部>>
李大舟;路莹;高巍;陈思思
沈阳化工大学 计算机科学与技术学院,沈阳 110142沈阳化工大学 计算机科学与技术学院,沈阳 110142沈阳化工大学 计算机科学与技术学院,沈阳 110142沈阳化工大学 计算机科学与技术学院,沈阳 110142
生物工程
microRNA靶向基因预测深度学习图卷积网络多头注意力机制
microRNATarget gene predictionDeep learningGraph convolutional networksMulti-head attention
《生物信息学》 2024 (3)
225-238,14
辽宁省教育厅科学研究项目(No.LJKZ0449,LJ2020033).
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