黍子SRS基因家族的全基因组鉴定与表达分析OA北大核心CSTPCD
植物特异性SHI-related sequence(SRS)转录因子在调控植物生长发育、激素生物合成和胁迫反应中起着至关重要的作用。本文研究了黍子(Panicum miliaceum)SRS基因家族(PmSRS),利用生物信息学方法分析了PmSRS的结构和功能,并通过转录组数据分析SRS基因在黍子不同组织和不同成熟阶段的基因表达水平。共鉴定出13个PmSRS,根据系统发育关系分为6个亚家族,且同一亚家族中的PmSRS成员包含相似的基因结构和基序组成。发现在PmSRS基因的启动子区存在39种与植物生长发育、植物激素、胁迫及光响应相关的顺式作用元件。此外,PmSRS5、PmSRS6可能在黍子生长时期发挥主要作用。本研究提供了黍子SRS基因家族的综合信息,有助于研究SRS基因的功能,并为黍子的分子改良提供了理论依据。
李佳祯;杨梦珂;宋晓涵;王月;王禹茜;王世纪;张美春;邓欣;王红艳;
辽宁大学生命科学院植物表观遗传与进化实验室,辽宁沈阳110036
农业科学
生物信息学分析比较基因组学系统发育分析保守结构域转录组黍子
《草业科学》 2024 (009)
P.2035-2045 / 11
国家自然科学基金项目(31100172);辽宁省科技厅自然科学基金计划面上项目(2022-MS-174);辽宁省教育厅重点攻关项目(JYTZD2023067);辽宁省博士科研启动基金计划项目(2021-BS-082)。
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