大豆GmEXPB3和GmEXPB6生物信息学分析及干旱和盐胁迫诱导表达OA北大核心CSTPCD
膨胀素(Expansin,EXP)通过调控细胞壁的松弛在植物应对环境胁迫过程中起着重要作用。为研究EXP基因在大豆应对干旱和盐胁迫过程中的作用,本研究对大豆中的两个EXP基因(GmEXPB3和GmEXPB6)进行生物信息学分析,通过实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)检测基因干旱和盐胁迫后的表达量。结果表明:GmEXPB3和GmEXPB6基因分别位于大豆第3和11号染色体上,编码的蛋白序列长度分别为267和277个氨基酸。GmEXPB3蛋白分子量为28.81 kDa,理论等电点为5.62;GmEXPB6蛋白分子量为29.37 kDa,理论等电点为4.95。GmEXPB3和GmEXPB6均为不稳定的亲水蛋白且定位于细胞壁中。GmEXPB3和GmEXPB6蛋白均含有1个保守的DPBB_1结构域。GmEXPB3蛋白与小麦TaEXPB10蛋白的亲缘关系最近,GmEXPB6蛋白与GmEXPB2蛋白亲缘关系最近。干旱胁迫能够诱导GmEXPB3的表达,但不能诱导GmEXPB6的表达。盐胁迫能够诱导GmEXPB3和GmEXPB6的表达。GmEXPB3的启动子区域含有5种与逆境有关的顺式作用元件,GmEXPB6的启动子区域含有4种与逆境有关的顺式作用元件。研究结果可为大豆EXPB基因抗逆机制的研究及应用提供理论依据。
李佳欣;孙莹莹;邓雅文;轩称心;马志强;马洪宇;张军;翟莹;
齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,黑龙江齐齐哈尔161006黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院,黑龙江齐齐哈尔161005
农业科学
大豆膨胀素EXPB生物信息学分析非生物胁迫表达分析
《大豆科学》 2024 (005)
P.559-564 / 6
黑龙江省大学生创新创业训练计划(S202310232113);黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(145109506)。
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