基于生物信息学分析鉴定促进非小细胞肺癌耐药的关键基因OA
目的通过生物信息学分析基因表达综合数据库(GEO数据库)中吉非替尼敏感和耐药非小细胞肺癌(NSCLC)细胞的基因表达谱,研究导致NSCLC获得性耐药的潜在关键基因,为耐药NSCLC患者的预后评价提供新思路。方法通过GEO2R网络工具分析GSE123066和GSE83666数据集识别差异表达基因(DEGs)。通过韦恩图比较2组数据之间的DEGs找出关键的候选基因,然后对候选基因进行基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,并对所得到的基因进行临床预后分析、肿瘤组织及不同分期中的表达水平进行分析。结果筛选到46个核心DEGs与NSCLC耐药显著相关,通过Cytoscape确定8个关键基因在NSCLC细胞的吉非替尼耐药进展中起重要作用,分别是SOD2、GADD45A、NCF2、LOX、CYR61、SOX2、JUP和MUC1,最后生存分析发现SOD2与NSCLC吉非替尼耐药高度相关。结论SOD2可能是导致NSCLC细胞对吉非替尼获得性耐药的关键基因,其高表达与NSCLC不良预后相关,表明SOD2可能是未来具有临床应用价值的潜在治疗靶点。
李佳月;付小雪;张瑞雪;孙梦瑶;杨金月;李旺;
山东航空学院生物与环境工程学院生物制药教研室,山东滨州256600
临床医学
非小细胞肺癌生物信息学吉非替尼耐药SOD2治疗靶点
《现代医药卫生》 2024 (020)
P.3432-3439 / 8
国家自然科学基金项目(82103018);山东省自然科学基金项目(ZR2021QH029);山东省大学生创新创业训练计划项目(S202310449349);山东航空学院教学研究项目(BYJYYB202229)。
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