组学技术在生防芽胞杆菌的应用进展OA北大核心CSTPCD

芽胞杆菌(Bacillus spp.)是全世界应用最广泛的生防微生物菌种资源之一,在基因组学成为普遍性基础学科的时代,转录组、蛋白质组、代谢组等多组学技术的联用成为深入揭示芽胞杆菌生物学特性和生防机制研究的重要手段。目前NCBI数据库共计发布了10813个芽胞杆菌全基因组序列,其中装配注释完整的共1842个,占总数量的17.04%。对芽胞杆菌基因组与比较基因组的分析发现,次级代谢产物基因簇是芽胞杆菌基因组中最具有保守性,又具有特异性的部分,它们既是天然产物的重要来源,也在细菌间以及细菌与环境的相互作用和生命周期中扮演着重要角色。截至目前,对于芽胞杆菌的相关研究,多采取整合组学模式和生物信息学计算方法,聚焦于芽胞杆菌的抗性形成、生物膜形成、定殖、促生、诱导植物抗逆性等机制。随着研究的不断深入,芽胞杆菌生防过程中的基因调控机制、蛋白质表达和代谢途径将进一步解析,这将有助于发现新的生防活性物质和优化生防策略。本文综述了转录组、蛋白质组、代谢组等多组学技术在芽胞杆菌上的研究进展,以期为芽胞杆菌生防作用机制的解析以及生防菌株改良的深入研究提供参考。