苋菜LAC基因家族成员全基因组鉴定与表达分析OA北大核心CSTPCD

漆酶作为生物体内一类重要的铜蓝蛋白,起着调控植物生长、抵抗逆境的作用。基于苋菜基因组及转录组数据,对苋菜漆酶基因家族成员(AtrLAC)进行鉴定,利用在线软件进行生物信息学分析,并根据转录组TPM值进行家族成员相对表达分析。结果表明,在苋菜基因组中共筛选获得19个LAC基因;AtrLAC家族蛋白长度范围在118~1191 aa之间,分子量为13.05~135.10 kD;理论等电点范围为6.49~9.85,多数为亲水呈碱性稳定的蛋白;亚细胞定位预测显示多数在细胞膜外或质膜上。系统进化树分析将苋菜19个LAC成员和拟南芥的17个LAC成员聚为6个类群。TPM值分析显示,AtrLACs在不同处理下的表达量存在差异,其中AtrLAC7基因可能在甜菜色素合成、响应激素调控及光条件下发挥重要作用。