阿旺绵羊群体结构及毛色性状关联分析OA北大核心CSTPCD

利用绵羊40K SNP液相芯片,对1003只阿旺绵羊进行SNP测定,结合阿旺绵羊的毛色表型,进行毛色性状的关联分析;计算个体间亲缘关系,与藏系绵羊、蒙古系绵羊、云南绵羊进行主成分分析、系统发育树的构建、祖先分析,筛选阿旺绵羊独特的分子标记。结果表明,阿旺绵羊是藏系绵羊,与蒙古羊和云南羊有较大差异,在藏羊中也是独特的类群;全基因组关联分析分析发现了阿旺绵羊的毛色黑/褐性状与基因组上14号染色体和20号染色体上的5个SNPs显著相关,这些SNPs临近或位于2个已知基因MC1R、TCF25。通过与国内外大样本绵羊基因组的比较,筛选到8个阿旺绵羊品种特异性SNP用于品种鉴定。综上所述,阿旺绵羊从基因组上具有特异性,是藏羊的独特遗传资源。