水稻IDD基因家族的全基因组鉴定及综合分析OA北大核心CSTPCD

[目的]明确植物特异转录因子Os IDD基因家族成员特征特性,验证其表达模式,为深入研究水稻IDD基因家族生物学功能奠定基础。[方法]通过Pfam鉴定与明确水稻IDD家族成员,对其核酸与蛋白序列特征、蛋白结构、系统发育与共线性、启动子元件进行综合分析;通过RT-PCR技术验证OsIDD基因在各组织、不同激素处理及不同非生物胁迫下的表达模式。[结果]发现Os IDD家族具有15个成员,为3个亚家族,在染色体上呈不均匀分布,N端均具有核定位信号及高度保守的ID结构域。多重序列比对及motif分析表明其在各个类型中相对保守,与玉米IDD基因家族共线性分析表明两个物种间具有高度同源性。芯片及RT-PCR分析发现Os IDD主要在穗及发育胚乳中表达量较高,其启动子序列均包含激素/胁迫响应顺式元件。[结论]本研究对15个OsIDD成员进行了综合分析,Os IDD结构保守,与Zm IDD共线性强,主要在穗及发育胚乳组织中高表达,可能参与不同激素及多种非生物逆境胁迫响应过程。