水稻孤雌生殖诱导基因BBM1序列变异分析OA北大核心CSTPCD

[目的]在水稻卵细胞中异位表达BBM1能够诱导孤雌生殖,挖掘BBM1优异等位变异和功能类似基因对水稻杂种优势固定具有重要意义。[方法]利用383份水稻核心种质的三代测序数据,对BBM1基因进行结构变异分析、序列多态性分析、单倍型分析,并根据序列相似度以及表达模式相似度筛选BBM1功能类似基因。[结果]BBM1基因在3份种质中存在两个拷贝,在2份野生稻中存在微型颠倒重复转座元件(MITEs)插入变异;具有非常明显的籼粳分化,94.80%的粳稻和3.80%的籼稻中BBM1因单碱基变异造成翻译提前终止,缺少26个氨基酸残基;BBM1编码区序列十分保守,绝大多数材料中具有相同的单倍型;筛选到BBM1序列和表达模式相似基因LOC_Os06g44750,其可能具有BBM1诱导孤雌生殖的功能。[结论]明确了水稻中BBM1基因变异情况,挖掘出重要单倍型和功能类似候选基因,为进一步提高水稻孤雌生殖频率奠定基础。