不同增殖速度的东海原甲藻细胞周期及转录组比较分析OA北大核心CSTPCD
为研究不同增殖速度的东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)细胞周期时相分布特点以及内在调控机理,利用流式细胞检测技术比较了两种不同增殖速度的东海原甲藻细胞周期时相差异,并利用RNA-seq技术对两组细胞转录模式进行了比较分析。结果显示,相比增殖速度较快的实验组,增殖速度较慢的实验组S期更短,且部分细胞阻滞在G2/M期。因此,S期的持续时间和G2/M期转换是否被阻滞可以决定东海原甲藻的增殖速率。两组细胞差异表达基因富集程度最大且富集最显著的GO分类均与微管和细胞骨架有关,暗示两实验组细胞周期进程的差异由细胞中的微管动态变化不同造成。注释到49个细胞周期蛋白编码基因、74个细胞周期蛋白依赖性激酶编码基因和26个细胞分裂周期蛋白编码基因。其中,1个CYCB和2个CDK1基因与调节东海原甲藻G2/M期阻滞有关,1个CYCA、1个CYCU、4个CDK2和1个Cdc48基因与藻细胞S期进程调控有关。
赵鹏珍;王云龙;马欣云;全为民;李楠楠;陈渊戈;范瑞良;张海燕;徐清;欧阳珑玲;
上海海洋大学水产与生命学院,上海201306 中国水产科学研究院东海水产研究所,农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室,上海200090中国水产科学研究院东海水产研究所,农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室,上海200090自然资源部宁波海洋中心,浙江宁波315012
水产学
东海原甲藻增殖速度细胞周期时相转录组差异表达基因赤潮
《中国水产科学》 2024 (009)
P.1116-1128 / 13
中国水产科学研究院东海水产研究所基本科研业务费项目(2016T04).
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