鸡酪氨酸酶(TYR)基因启动子区序列结构特征分析OACSTPCD

为解析鸡酪氨酸酶(Tyrosinase,TYR)基因启动子区序列的结构特征及其转录调控机制,本研究基于NCBI数据库中鸡TYR基因5''侧翼区与外显子1共计2944bp核苷酸序列,利用不同在线软件对其核心启动子区、基本调控元件、转录因子结合位点与CpG岛等结构开展生物信息学预测分析,运用DNASTAR.Lasergene 17.3和MEGA 5.0软件对不同物种TYR基因启动子区序列进行相似性分析和系统进化树构建。结果表明,起始密码子上游1500~2 100 bp为鸡TYR基因潜在的候选核心启动子区域;5''侧翼区1604bp存在1个潜在的转录起始位点C;该基因启动子区存在1个CAAT-box、9个TATA-box和15个E-box,不存在CpG岛结构域。综合多种在线软件预测鸡TYR基因启动子区存在C/EBPalp、GATA-1、Oct-1、TBP、Sp1、NF-1、AP1、SRF和NF-κB等转录因子结合位点。鸡TYR基因启动子区序列与环颈雉、火鸡、鹌鹑、绿头野鸭、棕硬尾鸭、凤头潜鸭、猪、普通牛、水牛、杂交牛、山羊、绵羊、赤鹿、白尾鹿、马鹿和林麝相似性在41.2%~89.7%之间。系统进化树表明,鸡与鹌鹑、环颈雉和火鸡亲缘关系较近,与猪亲缘关系较远。本研究结果可为进一步探明鸡色素沉积关联TYR基因的转录调控机制提供理论依据。