基于SNP标记对嘉定白蚕豆遗传多样性与特异性的鉴定OACSTPCD
为了在基因组水平上揭示嘉定白蚕豆的遗传特性,基于简化基因组测序技术,研究了嘉定白蚕豆种质的遗传多样性,及其与其他来源蚕豆种质的遗传差异,并利用检测到的SNP进行了主成分分析、聚类分析与群体遗传结构分析。结果表明:142份蚕豆种质资源中共检测到30984个SNP。主成分分析可大致区分嘉定材料与其他材料,聚类分析将这142份材料划分为上海嘉定、上海其他和其他省份材料为主的三簇,而群体遗传结构分析则显著区分了嘉定材料与其他材料。从上述SNP中筛选了18个在嘉定和其他材料间存在高分化的SNP标记,均匀分布在6对染色体上,利用这些SNP可准确鉴定(准确率78%)嘉定白蚕豆核心材料。本研究可为嘉定白蚕豆种质资源的保护、研究和利用提供重要的技术支撑。
杨华;陈珏;龙萍;王磊;韩静;邹丹蓉;夏辉
上海市农业生物基因中心,上海201106上海市嘉定区农业技术推广服务中心,上海201800上海市农业生物基因中心,上海201106上海市农业生物基因中心,上海201106上海市农业生物基因中心,上海201106上海市嘉定区农业技术推广服务中心,上海201800上海市农业生物基因中心,上海201106
园艺学与植物营养学
嘉定白蚕豆遗传多样性遗传特异性简化基因组测序SNP标记
《上海农业学报》 2024 (6)
P.1-8,8
上海市科技兴农项目(2021-02-08-00-12-F00757)上海市农作物种质资源共享服务平台(21DZ2290600)。
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