北京某区羊粪中产志贺毒素2k、2l新亚型大肠埃希菌的检出及病原特征分析OA北大核心CSTPCD
目的对北京某区羊携带产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)情况和病原特征进行分析,为STEC感染风险评估、溯源调查及科学防控提供支持。方法采集北京市某区散养羊粪便标本并进行STEC分离培养,对分离菌株进行15种抗生素耐药性检测和全基因组测序,基于菌株全基因序列进行多位点序列分型(MLST)、血清分型、志贺毒素分型以及核心基因组单核苷酸多态性(cgSNP)系统进化分析。结果2019-2020年采集的129份羊粪便样本共分离5株STEC,检出率为3.88%(5/129);5株菌分为4种血清型、4种MLST型和3种志贺毒素亚型(stx1a、stx2k、stx2l),菌株对氨苄西林等15种抗生素均为敏感。全基因组系统进化分析显示,stx2k亚型菌株与本地分离的腹泻患者来源stx2k-STEC菌株亲缘关系较远;而stx2l亚型菌株与本市分离的食品来源stx2l-STEC菌株亲缘关系较近。结论本地区羊源性STEC菌株特征呈多样性,并有stx2k和stx2l新亚型检出,其对人的感染风险需进一步监测和评估。
王鹏;周乐乐;王均竹;王苗;李颖;杨茜;张爽;熊衍文
北京市顺义区仁和镇卫生院,北京101306河北北方学院,张家口075132内蒙古科技大学包头医学院,包头014040北京市顺义区疾病预防控制中心,北京101300北京市顺义区疾病预防控制中心,北京101300中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京102206北京市顺义区疾病预防控制中心,北京101300中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京102206
基础医学
产志贺毒素大肠埃希菌基因组测序分子分型抗生素敏感性
《中国人兽共患病学报》 2024 (12)
P.1146-1151,6
国家自然科学基金项目(No.82072254).
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