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一株自絮凝细菌Massilia sp.W12的多相分类鉴定及全基因组分析OA北大核心

中文摘要

研究以筛选自絮凝菌作为生物絮团系统外源强化菌株为目的,从中华草龟养殖池塘中分离纯化出一株自絮凝菌株,对其进行多相分类学鉴定确定W12菌株的分类地位,基因注释分析探讨其作为强化菌株的可行性。W12菌株与Massilia arenosa MC02^(T)相似性最高,为96.21%,W12菌株与其亲缘关系较近的几株模式菌株的ANI值在71.61%—72.23%,dDDH值在19.6%—22.9%,远低于判别细菌新种的阈值,进一步表明W12为一株马赛菌属新种。此外,全基因组分析发现W12的自絮凝机制可能与喜树脂动胶菌相似,由胞外多糖和PEPCTERM蛋白质共同介导,推测菌株W12通过PHB合成途径Ⅰ涉及PhaA、PhaB和PhaC三种酶来合成PHB。研究从中华草龟养殖池塘分离到的自絮凝菌株W12是一株马赛菌属新种,W12菌株可以合成PHB,由胞外多糖和PEP-CTERM蛋白质共同介导其自絮凝,此性能与生物絮团的形成息息相关。通过基因组分析对菌株的潜在应用价值进行挖掘,以期为生物絮团系统的功能强化提供候选菌株。

高娜;陈诚;赵秀侠;方婷;崔凯;卢文轩

安徽省农业科学院水产研究所,安徽省水产增养殖重点实验室,合肥230031安徽省农业科学院水产研究所,安徽省水产增养殖重点实验室,合肥230031安徽省农业科学院水产研究所,安徽省水产增养殖重点实验室,合肥230031安徽省农业科学院水产研究所,安徽省水产增养殖重点实验室,合肥230031安徽省农业科学院水产研究所,安徽省水产增养殖重点实验室,合肥230031安徽省农业科学院水产研究所,安徽省水产增养殖重点实验室,合肥230031

水产学

多相分类自絮凝胞外多糖PEP-CTERM蛋白质马赛菌

《水生生物学报》 2025 (2)

P.167-174,8

安徽省重点研究与开发计划(2022107020008)安徽省农业科学院青年英才计划(QNYC-202108)国家现代农业产业技术体系专项(CARS-46)资助。

10.7541/2024.2024.0241

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