基于SSR分子标记的核桃涩味遗传多样性分析OA北大核心CSTPCD

为研究核桃种质资源涩味的遗传多样性,以4个不同核桃涩味群体共118份种质资源为材料,利用SSR毛细管电泳荧光标记技术进行遗传多样性研究,并构建树状聚类图。结果表明:12对引物共检测到93个等位变异位点,变异范围为2~18,平均每对SSR引物可检测到7.75个等位位点;多态性信息量(PIC)为0.3579~0.7852,平均0.5411。4个群体的多态位点数Np为91、多态位点百分率PPB为97.85%、观测等位基因数Na为1.9785、有效等位基因数Ne为1.1985、Shannon′s信息指数I为0.2097、Nei′s多样性指数H为0.1263、总遗传多样性指数Ht为0.1267、群体内遗传多样性指数Hs为0.1222,说明4个核桃群体的遗传多样性和变异度不高。群体间遗传分化系数Gst为0.0355,说明群体内遗传变异占总变异的96.45%。其中稍涩群体多态性位点百分率最大,为72.04%,说明稍涩群体在4个群体中遗传多样性最丰富。UPGMA聚类分析表明,4个群体的遗传相似系数为0.9898~0.9971,群体的整体相似系数高,说明这4个群体的遗传距离很近。当相似系数为0.9934时,可将4个群体分成2组。其中,第1组包括不涩、稍涩和较涩3个群体,剩余涩群体单独为一组。通过计算不同群体93个位点的基因频率,发现12对引物的41个位点可将不同涩味等级的资源区分开。利用SSR分子标记技术对4个核桃群体进行与涩味相关的遗传多样性分析,根据转录组测序结果筛选出12对引物用于SSR分析,共扩增出93个SSR位点,多态位点百分率为97.85%,说明引物的多态性高,适用于核桃的遗传多样性分析,为培育轻涩味的优良品种提供技术指导,可用于后续核桃涩味的遗传多样性及育种研究。