双硫死亡相关基因影响预后及肿瘤微环境的泛癌分析OA

目的基于生物信息学方法评估双硫死亡相关基因(DRGs)在泛癌中对预后及免疫的潜在作用。方法使用TCGA及多种开源在线数据库内包含的泛癌RNA-seq数据、突变情况、临床信息、TMB、MSI、干性评分和肿瘤及免疫微环境数据及多组R语言算法综合分析。使用qPCR对细胞层面的DRGs表达情况行实验验证。结果LRPPRC、NCKAP1、NDUFS1和NUBPL在肾透明细胞癌中的预后较好(P<0.001),而SLC7A11、NCKAP1和SLC3A2在肝细胞癌中的预后较差(P<0.01)。在TME分析中,LRPPRC与所有肿瘤类型中的免疫细胞、基质细胞和估计评分均呈负相关。TMB分析结果揭示了DRGs在泛癌中PD-1/PD-L1治疗的潜在研究价值。药物敏感性分析发现SLC7A11(r=0.454)、SLC3A2(r=0.366)和NCKAP1(r=0.455)与Kahalide F明显相关(P<0.01)。实验验证表明了GYS1与NCKAP1在肺腺癌、结肠腺癌、食管鳞癌与肝细胞癌中总体表达高于正常细胞,且存在差异(P<0.05)。结论通过对DRGs的泛癌分析表明,DRGs可能作为肾透明细胞癌、肺腺癌、肝细胞癌诊断及预后的重要生物标志物。