免疫细胞与肝细胞癌风险的遗传决定因素:一项基于生物信息学和双向孟德尔随机化的研究OA

目的基于生物信息学及特定算法筛选肝细胞癌的核心靶点并探讨其与免疫细胞的关系,并通过孟德尔随机化方法探讨免疫细胞与肝细胞癌的因果关系。方法通过GEO和TCGA数据库对肝细胞癌发生的相关基因进行筛选,并通过GSVA和CIBERSORT算法进行免疫浸润分析,随后对免疫细胞与肝细胞癌的因果关系进行双向孟德尔随机化分析。结果筛选出284个肝癌相关基因,在蛋白互作网络中获取到120个相关基因。孟德尔随机化结果显示:髓系细胞中的HLA DR on CD33^(+)HLA DR^(+)CD14dim(OR=1.097,95%CI:1.002~1.201,P=0.045,P_(Bonferroni)=0.091)和调节性T细胞中的CD8 on CD28^(+)CD45RA^(+)CD8^(+)T cell(OR=1.123,95%CI:1.027~1.228,P=0.011,P_(Bonferroni)=0.022)是肝细胞癌的危险因素;肝细胞癌是经典树突状细胞中的HLA DR^(++)monocyte Absolute Count(OR=0.812,95%CI:0.702~0.938,P=0.005,P_(Bonferroni)=0.139)的保护因素。免疫浸润分析显示,关键基因与交集免疫细胞之间具有较好的相关性。结论肝癌的发生发展可能与CDK1、CCNB1、CDC20有关,并与Th2 cells、T helper cells及Th17 cells、DC等呈现较高程度的相关性,孟德尔随机化显示HLA DR on CD33^(+)、HLA DR^(+)CD14dim和CD8 on CD28^(+)、CD45RA^(+)CD8^(+)T cell与肝细胞癌的风险增加有关,而肝细胞癌的发生风险与HLA DR^(++)monocyte Absolute Count的水平降低有关。