CYBB和CSF1R在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的表达及诊断价值OA北大核心

目的采用生物信息学方法分析慢性鼻窦炎鼻息肉(CRSwNP)基因表达的特点,探寻CRSwNP潜在的生物标志物及其诊断价值。方法(1)从美国GEO基因表达数据库下载CRSwNP基因表达数据集,通过数据分析筛选CRSwNP与健康对照的差异表达基因(DEGs);对获取的DEGs进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,利用cytoHubba插件筛选关键基因。利用Cibersort包分析关键基因对常见免疫细胞的影响。(2)选取2022年6月-2023年6月在河北北方学院附属第一医院确诊的32例CRSwNP患者为CRSwNP组,另选取同期无鼻窦炎病史的单纯鼻中隔偏曲患者21例作为对照组。HE染色观察两组标本的病理学特点,免疫组化和Western blotting检测CRSwNP关键基因的表达水平,ELISA法检测血浆关键蛋白的水平,并绘制ROC曲线分析关键蛋白诊断CRSwNP的效能。结果(1)对获取的3个基因表达数据库集(GSE36830、GSE23552和GSE194282)进行分析显示,CRSwNP有156个DEGs;GO功能和KEGG通路分析显示,上述DEGs的作用多与免疫功能有关;筛选出细胞色素b-245β链(CYBB)和集落刺激因子1受体(CSF1R)等关键基因。(2)HE染色结果显示,CRSwNP组织上皮化生为复层鳞状上皮,间质水肿;免疫组化和Western blotting检测结果显示,与对照组比较,CRSwNP组CYBB、CSF1R表达水平均明显升高(P<0.05)。ELISA检测结果显示,与对照组比较,CRSwNP组血浆CYBB[(21.20±3.00)μg/ml vs.(17.66±1.66)μg/ml,P<0.001]和CSF1[(477.37±86.63)pg/ml vs.(370.71±66.24)pg/ml,P<0.001]水平均明显升高。ROC曲线分析显示,血浆CYBB和CSF1水平诊断CRSwNP的曲线下面积(AUC)分别为0.888(95%CI 0.802~0.974)、0.821(95%CI 0.711~0.931),二者联合诊断CRSwNP的AUC为0.927(95%CI 0.851~1.000)。结论CYBB、CSF1R可能参与了CRSwNP的发生发展,血浆CYBB、CSF1水平可能成为CRSwNP的诊断标志物。