基于转录组挖掘野生和栽培余甘子类黄酮生物合成关键基因OA

目的:探讨野生和栽培余甘子类黄酮代谢差异的分子机制,挖掘二者间类黄酮合成差异的关键酶基因。方法:以四川野生余甘子和广东栽培余甘子果实和叶片为实验材料,用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行转录组测序,通过Nr、基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库注释分析比较两种余甘子转录组的差异,筛选出类黄酮合成途径的关键酶。结果:共得到81378条Unigene,N50长度为1573 bp。Nr数据库注释发现余甘子与橡胶树的同源性最高,KEGG富集分析表明,相比栽培余甘子,类黄酮合成通路中CHS、CHI、FLS、DFR和LAR主要在野生余甘子果和叶中上调。结论:共鉴定出81个参与类黄酮生物合成途径的基因,其中CHS、FLS、LAR可能是余甘子调控黄酮类化合物积累的关键基因。参与类黄酮合成途径的CHI、CHS、FLS、LAR等关键基因均主要在野生余甘子组织中上调表达,导致野生余甘子黄酮类产物含量高于栽培余甘子,野生环境下干旱和高紫外辐射可能影响余甘子组织中黄酮类化合物的积累模式。