不同驴皮转化效率德州驴的皮肤及粪便微生物群落定植规律研究OA北大核心

[目的]分析不同驴皮转化效率德州公驴的背部和颈部皮肤、粪便微生物群落的差异定植规律。[方法]基于3 000头驴皮厚度均一的德州黑毛驴(公)群体,饲喂相同基础饲粮,对背部和颈部皮肤厚度进行连续监测,筛选出驴皮(背部和颈部)厚度增量高、低组各7头,通过测定16S rRNA扩增所获序列,进行背部和颈部皮肤、粪便微生物群落的组成和功能分析。[结果]驴皮厚度增量高、低组间驴皮厚度变化存在显著差异(P<0.05),背部和颈部皮肤、粪便微生物Alpha多样性均无显著差异(P>0.05),而主坐标分析(principal co-ordinates analysis, PCoA)显示两组间的微生物群落聚类有不同程度的差异(P<0.05),韦恩图显示两组驴皮背部和颈部皮肤、粪便微生物均存在共有扩增子序列变异(amplicon sequence variant, ASV)或特有ASV。门水平显示,两组的不同部位以厚壁菌门、放线菌门、绿弯菌门、变形菌门、拟杆菌门等为主要优势菌;属水平显示,两组的不同部位以狭义梭菌属1、棒状杆菌属、链球菌属、鸟氨酸微菌属为优势菌属,其中链球菌属为粪便的优势菌属,鸟氨酸微菌属为颈部和背部皮肤的优势菌属。通过差异物种分析,与颈部驴皮厚度增量低组相比,23个属水平菌富集于颈部驴皮厚度增量高组;与背部驴皮厚度增量低组相比,7个属水平菌富集于颈部驴皮厚度增量高组;与驴皮厚度增量低组的粪便相比,13个属水平菌富集于驴皮厚度增量高组的粪便。[结论]驴皮厚度增量不同的德州驴皮肤微生物群落结构、功能存在差异,相比粪便,皮肤组织的微生物多样性具有更高的趋势。本研究结果为解析德州驴微生物定植规律、驴皮转化效率潜在调控机制提供了理论依据。