基于全基因组重测序数据评估信阳水牛保种效果OA北大核心
为了解信阳水牛的种质资源现状,本研究利用全基因组重测序技术,对 30 头信阳水牛基因组遗传多样性、群体遗传结构和连续纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)等指标进行分析,评估其保种效果.结果如下:信阳水牛遗传多样性丰富,最小等位基因频率为 0.195,平均多态信息含量为 0.277,平均期望杂合度为 0.280,平均观察杂合度为 0.269,平均核苷酸多样性为 2.586.家系分析将 30 头信阳水牛分为 6 个家系;30 头信阳水牛个体共检测到 3 578 个ROH,长度在 0～0.5 Mb的ROH片段占比最多,基于ROH值计算的群体近交系数范围介于 0.000 4～0.091 9,平均近交系数为 0.020 1.综上,信阳水牛群体遗传多样性较为丰富,整体上保持了较低的近交水平,保种效果良好,建议后续适当引入新血缘与少数高近交水平个体交配.
魏稚彤;高攀;高腾云;祁兴磊;王二耀;张子敬;刘贤;梁栋;付彤
河南农业大学动物科技学院,河南 郑州 450046泌阳县农业综合行政执法大队中心,河南泌阳 463700河南农业大学动物科技学院,河南 郑州 450046泌阳县畜牧技术服务中心,河南泌阳 463700河南省农业科学院畜牧兽医研究所,河南 郑州 450002河南省农业科学院畜牧兽医研究所,河南 郑州 450002河南省畜牧总站,河南 郑州 450008河南农业大学动物科技学院,河南 郑州 450046河南农业大学动物科技学院,河南 郑州 450046
畜牧业
信阳水牛全基因组重测序遗传多样性ROH
《中国畜牧杂志》 2025 (2)
150-156,7
国家自然科学基金青年项目(32202636)河南省重大科技专项(221100110200)河南省肉牛产业技术体系HARS-22-13-T
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