1株动物源碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌基因组及耐药质粒水平扩散研究OA北大核心

肺炎克雷伯菌(KP)可引起呼吸道、泌尿生殖系感染,创伤、败血症及腹泻,是一种重要的人畜共患病原体。本研究利用细菌基因组三代测序技术和生物信息学平台,对前期工作中分离出的奶牛场养殖环节来源肺炎克雷伯碳青霉烯耐药菌KP329进行了基因组分析及碳青霉烯耐药机制研究。结果显示:KP329染色体总长度为5 337 963 bp,共编码5163个基因,GC含量为57.3%,含有23个耐药基因,MLST分型显示KP329为肺炎克雷伯菌ST101型;KP329携带3个质粒,大小分别为291 962 bp(KP329-1)、105 109 bp(KP329-2)以及4572 bp(KP329-3),其中KP329-1为多重耐药质粒,含有10个耐药基因:aac(3)-IIa、qnrS1、LAP-2、sul1、qacEdelta1、sul2、dfrA1、tet(A)、aph(6)-Id、aph(3'''')-Ib,KP329-2只含有1个耐药基因(blaKPC-2),而KP329-3不含有任何已知耐药基因;尽管KP329外膜蛋白OmpK35/OmpK36/ OmpK37发生了氨基酸突变,但对KP329碳青霉烯药物敏感性并无显著影响。细菌结合转移实验则表明,KP329-2质粒可在不同种属细菌发生水平转移,增加宿主菌对碳青霉烯及其他抗生素的抵抗性,具有较高的环境扩散风险。