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- 基因与细胞图共驱动的协同自编码插补算法北大核心摘要:为解决单细胞RNA测序数据中存在大量丢失值的问题,提出了一种基因与细胞图共驱动的协同自编码网络插补(CoImpute)算法。该算法利用基因-细胞图神经网络模块,提取基因维度和细胞维度上的生物相似和差异信息,协同辅助基于零膨胀负二项分布的自编码网络,系统全面地恢复单细胞RNA测序数据中的丢失值,且辅助过程创新性地采取图空间上下文感知策略。结果表明,CoImpute算法在14个数据集上的平均绝对误差为0.01~0.21,皮尔森相关系数为0…查看全部>>