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细胞培养稳定同位素标记技术的发展及其在脑病研究中的应用北大核心CSCDCSTPCD
作者：朱丽刘安杨洪军陈畅李德凤吴传鸿高健李韶菁
发表期刊：中国药理学通报 2012年7期
关键词：定量蛋白质组学SILAC脑病神经血管单元中药网络药理学
摘要：寻找脑中特异的蛋白标记物,对于脑病临床诊断及药物机制研究至关重要.人脑是一个复杂的有机体,采用单靶点、非动态、局部的方法不适于脑病研究,而以质谱技术为基础的定量蛋白质组学的出现和发展,加快了脑病标志分子的研究进程.细胞培养稳定同位素标记技术(SILAC)作为精确的蛋白定量方法,是系统、动态的研究方法,为脑病机制和治疗脑病中药的研究提供了新的思路.
基于生物质谱的乙酸酐稳定同位素标记北大核心CSCDCSTPCD
作者：刘新应万涛周春喜蔡耘钱小红
发表期刊：分析化学 2007年12期
关键词：乙酸酐稳定同位素标记定量蛋白质组学生物质谱
摘要：建立了一种基于生物质谱的乙酸酐稳定同位素标记,定量蛋白质组学研究方法,优化了影响标记效率的各种条件.在pH 8.0的Na2B4O7/H3BO3 缓冲体系中,当乙酸酐摩尔浓度25倍过量于肽段摩尔量,22℃反应30 min时,标记即可完全.对多对H6/D6-乙酸酐标记肽段在基质辅助激光解吸电离质谱中的动态范围及定量准确度进行了考察,并通过串联质谱分析确定了乙酰化位点.结果表明: 在10倍和30倍动态范围内,线性关系良好(r=0.99…查看全部>>
定量蛋白质组学技术构建系统性红斑狼疮疾病的蛋白质组差异表达图谱北大核心CSCDCSTPCD
作者：王林纤戴勇文锦丽涂植光张丽齐素文
发表期刊：中国病理生理杂志 2011年1期
关键词：定量蛋白质组学红斑狼疮系统性单个核细胞
摘要：目的:应用定量蛋白质组学技术对系统性红斑狼疮(SLE)病人外周血单个核细胞中的"全组"蛋白进行鉴定和定量分析,获得SLE的蛋白质组差异表达图谱.方法:利用基于四重相对和绝对定量的等量异位标签结合多维液相色谱-串联质谱分析SLE稳定期和活动期病人以及类风湿关节炎病人和健康人的外周血单个核细胞总蛋白,用肽质量指纹谱经数据库检索鉴定蛋白质,并比较这些蛋白的表达差异.结果:共鉴定了400多个蛋白质.其中,与健康对照组相比,SLE稳定组和SLE…查看全部>>
CDC42在HBx介导肝细胞恶性转化中作用的定量蛋白质组学研究北大核心CSCDCSTPCD
作者：徐永茹齐英姿徐平李湘萍徐锋
发表期刊：军事医学 2016年9期
关键词：定量蛋白质组学细胞骨架肝细胞癌CDC42基因缺失
摘要：目的寻找在乙肝病毒 X 蛋白（HBx）诱发肝细胞恶性转化过程中 CDC42信号通路发挥作用的介导因子。方法利用基于质量亏损的准等重二甲基标记（pIDL）的定量蛋白质组学方法，检测 CDC42基因敲除前后HBx 转基因细胞蛋白质组的差异。筛选差异蛋白并对差异蛋白进行基因本体（gene ontology，GO）功能分析。结果与结论共定量到3409个蛋白，筛选出220个差异蛋白，通过 GO 分析发现与细胞骨架组织相关的 palladin、成…查看全部>>
激光捕获显微切割纯化的人正常支气管上皮与肺鳞癌组织的定量蛋白质组学研究CSTPCD
作者：许艳曾谷清金龙玉汤参娥李萃肖志强
发表期刊：国际病理科学与临床杂志 2011年3期
关键词：肺鳞癌差异蛋白质激光捕获显微切割定量蛋白质组学iTRAQ
摘要：目的:建立肺鳞癌(human lung squamous carcinoma,HLSC)组织与正常支气管上皮(normal human bronchial epithelial,NHBE)组织的差异蛋白质表达谱.方法:运用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)技术从HLSC及NHBE组织中分别纯化HLSC和NHBE细胞,应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for r…查看全部>>
集成化蛋白质组定量分析平台的构建及应用北大核心CSCDCSTPCD
作者：周愿张珅袁辉明张丽华张玉奎
发表期刊：色谱 2014年4期
关键词：集成化蛋白质组定量分析平台蛋白质标记定量蛋白质组学亲水型固定化酶反应器
摘要：为提高蛋白质组定量分析的准确度、通量和自动化程度，构建了由微升级混合离子交换色谱、亲水型固定化酶反应器（hIMER）和纳升级反相色谱-电喷雾串级质谱（nanoRPLC-ESI-MS / MS）组成的集成化蛋白质定量分析平台。该平台实现了二甲基化标记蛋白质样品在线分离、酶解、肽段分离鉴定和定量分析。采用质量比为1：1的轻、重标记的蛋白质样品考察该平台的定量性能，发现蛋白质水平二甲基化标记效率为90％；蛋白质经 hIMER 在线酶解10 …查看全部>>
定量蛋白质组学在动物睾丸蛋白研究中的应用进展北大核心CSCDCSTPCD
作者：卢曾奎马友记
发表期刊：生物技术通报 2016年12期
关键词：定量蛋白质组学睾丸动物进展
摘要：蛋白质组学是后基因时代重要的研究领域之一。而定量蛋白质组学是蛋白质组学研究的主要方法之一，可以反映蛋白质的动态本质。睾丸作为雄性动物重要的生殖器官，具有产生精子和分泌雄激素的功能。因此，应用蛋白质组学方法来探索睾丸中蛋白质的组成具有重要意义。就定量蛋白质组学的概念、研究技术手段及其在动物睾丸发育、疾病和各种应激条件下等方面的应用进行综述，旨在为睾丸蛋白质的进一步研究提供参考。
基于局部回归的色谱保留时间对齐可逆算法北大核心CSCDCSTPCD
作者：李龙张纪阳史秀建孙汉昌谢红卫欧阳辰星
发表期刊：中南大学学报（自然科学版） 2011年1期
关键词：液质联用串联质谱定量蛋白质组学色谱保留时间对齐局部回归可逆算法
摘要：提出并实现一种基于局部回归的对齐算法,选择鉴定结果最多的一次实验作为参考,实现色谱保留时间的可逆对齐,将n次实验的对齐建模次数从n(n-1)/2次减少为,n-1次.该算法还实现不同实验间色谱保留时间的非线性对齐,并且能够克服少量从色谱柱中多次流出肽段的影响.研究结果表明:该方法计算时间复杂度远比现有算法的低,对齐精度也能够满足后续计算的需要.
不同转移潜能鼻咽癌细胞株的差异膜蛋白质组研究CSTPCD
作者：陈瑜李娇阳李茂玉肖志强
发表期刊：国际病理科学与临床杂志 2012年6期
关键词：鼻咽癌转移膜蛋白质组定量蛋白质组学18O标记
摘要：目的:采用定量蛋白质组学技术筛选鼻咽癌转移相关的膜蛋白质.方法:在富集高转移鼻咽癌细胞株5-8F和不转移鼻咽癌细胞株6-10B膜蛋白质的基础上,采用稳定同位素18O标记结合串联质谱技术比较两株细胞膜蛋白质组的差异,采用Western印迹对差异表达膜蛋白质EphA2的表达水平进行验证,采用生物信息学方法对差异蛋白质进行GO(gene oncology)功能聚类和全基因组及代谢途径数据库(Kyoto encyclopedia of gen…查看全部>>
人肝癌细胞敲低Rab27 B后的差异蛋白质组初步研究北大核心CSCDCSTPCD
作者：李佳树陈宁孙薇
发表期刊：军事医学 2016年8期
关键词：Rab27B肝肿瘤定量蛋白质组学
摘要：目的：通过分析敲低Rab27B后肝癌细胞蛋白质表达的变化，研究其在肿瘤细胞中的作用及可能的分子机制。方法在人肝癌细胞系MHCC97H中利用Tet-on系统和RNA干扰（RNAi）技术敲低Rab27B 表达，利用iTRAQ定量蛋白质组学技术比较敲低前后肿瘤细胞蛋白表达的差异，并对其进行亚细胞定位、生物过程和分子功能等生物信息学分析。结果 MHCC97H细胞敲低Rab27B后共鉴定到448种差异蛋白[比值（｜Ratio｜）＞1．21， P…查看全部>>

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