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- 四种常用高通量测序拼接软件的应用比较CSTPCD摘要:新一代测序平台的诞生推动了对全基因组鸟枪法测序数据的拼接算法和软件的研究,自2005年以来多种用于高通量测序的序列拼接软件已经被开发出来,并且在不断地进行改进以提高拼接效果.本文利用目前广泛使用的高通量测序拼接软件Velvet、AbySS、SOAPdenovo和CLC Genomic Workbench分别对本试验室分离的一株噬菌体IME08的高通量测序结果进行拼接,介绍这几种拼接软件的安装使用及参数优化,并对不同软件的拼接结果进行比…查看全部>>
- 基于第二代测序数据识别肿瘤基因突变的工具比较
- 利用目标基因捕获结合第二代测序技术发现腹主动脉瘤致病基因突变北大核心CSTPCD
- 人体口腔微生物宏基因组的研究进展北大核心CSCDCSTPCD
- 循环肿瘤DNA在头颈部肿瘤中的研究进展
- 高通量测序及其在食物网解析中的应用进展北大核心CHSSCDCSCDCSTPCD摘要:高通量测序是DNA测序技术发展中的重大突破,它的出现为现代生物科学研究提供了前所未有的机遇,例如基于猎物和寄主植物DNA分子解析生态系统的食物网研究已逐渐成为捕食性动物与植食性动物食物网研究的新型模式.在简要总结Roche 454、Illumina和Ion Torrent为代表的第二代测序技术的原理及最新进展的基础上,综述了近年来利用高通量测序技术在捕食性和植食性动物食物网解析构建研究方面取得的最新进展及存在的问题,以期为探索捕食性和…查看全部>>
- 温补脾肾法对脾肾阳虚型UC大鼠结肠组织趋化因子信号通路的影响北大核心CSCDCSTPCD
- NTRK基因融合与肿瘤的发生及相关诊疗的研究进展摘要:神经营养因子酪氨酸受体激酶(NTRK)基因融合于1986年在结直肠癌中首次被发现,这种致癌的NTRK基因融合已经被发现存在于多种不同组织学类型的成人和儿童肿瘤中。NTRK基因融合为靶向治疗提供了新的靶点,目前针对该种基因突变的不限年龄、不限肿瘤类型的广谱抗癌药Larotrectinib和Enrectinib也已经在美国、日本、欧洲地区批准上市。本文将从原肌球蛋白受体激酶(TRK)蛋白的生理与功能、NTRK基因融合与肿瘤发生、NTRK基…查看全部>>
- 序列比对算法中的BW变换索引技术研究及其改进北大核心CSCDCSTPCD
- 口咽鳞状细胞癌中HPV DNA检测的研究进展CSTPCD