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- 2004（9）
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- 鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究北大核心CSCDCSTPCD摘要：目的探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系.方法对36株鼠疫耶尔森菌和7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析,鉴定差异区段(DFR),并对260株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证,分析各DFR在这些鼠疫耶尔森菌中的分布,同时进行基因组岛分析.结果在鼠疫耶尔森菌基因组中鉴定出22个DFR,基于DFR图谱,将鼠疫耶尔森菌中国分离株分成14个基因组型.鼠疫耶尔森菌共有21个基因组岛,其中18个已存在于假结…查看全部>>
- 鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片的研制及用于比较基因组学分析北大核心CSCDCSTPCD
- 鼠疫耶尔森菌生物型变异遗传基础的研究和新生物型--田鼠型的提出北大核心CSCDCSTPCD摘要：目的探究鼠疫耶尔森菌生物型变异的遗传基础.方法通过全基因组序列的比较分析,鉴定可能与生物型变异相关的基因突变,采用DNA测序和位点特异性PCR的方法,分析基因突变在鼠疫耶尔森菌自然分离株中的分布.结果田鼠鼠疫自然疫源地菌株在毒力、生化表型和分子特征上与其他型别鼠疫耶尔森菌相差很大.所有脱氮阴性菌株的napA基因发生了突变,所有甘油利用阴性菌株的glpD基因发生了突变,所有阿拉伯糖利用阴性菌株的araC基因发生了突变.结论提出了一个新的…查看全部>>
- 鼠疫耶尔森菌活疫苗株的比较基因组学研究北大核心CSCDCSTPCD
- 鼠疫耶尔森菌DNA标识序列的鉴定及其应用研究北大核心CSCDCSTPCD摘要：目的确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定.方法通过芯片比较基因组杂交和PCR验证,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列,针对标识序列设计特定的PCR引物.结果鼠疫耶尔森菌基因组中存在3个区段,共28条基因,均是鼠疫耶尔森菌DNA标识序列.针对其中3条基因设计PCR引物,能特异性扩增出鼠疫耶尔森菌,与来自其他非鼠疫耶尔森菌的DNA无交叉反应.结论鼠疫耶尔森菌存在DNA标识序列,并能用于鼠疫耶尔森菌的快速检测与鉴定.
- 鼠疫耶尔森菌菌株91001全基因组序列测定及初步分析北大核心CSCDCSTPCD摘要：目的测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株91001的全基因组序列,并通过比较基因组学研究,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线.方法采用全基因组鸟枪法测定91001菌株的全基因组序列,利用比较基因组方法对91001与另外2株鼠疫耶尔森菌(CO92和KIM)的全基因组进行比较研究.结果 91001菌株的基因组包括1条染色体和4个质粒(pPCP1、pCD1、pMT1和pCRY).pPCP1质粒长度为9 609bp,与参考…查看全部>>
- 鼠疫耶尔森菌pgm位点及其侧翼序列遗传变异的比较分析北大核心CSCDCSTPCD摘要：目的研究鼠疫耶尔森菌中国自然分离株pgm位点及其侧翼序列的变异,了解不同疫源地菌株间的毒力差异,为鼠疫防治提供帮助.方法比较分析现有4株菌的pgm位点及其侧翼序列的变异,采用PCR、等位基因特异性PCR扩增260株中国自然分离株和7株假结核耶尔森菌.结果除锡林郭勒高原型和青海田鼠型菌株外,其他菌株均缺失了YP1666的70～87bp之间的18bp碱基.1 406bp处T的缺失仅存在于东方型菌株中.北天山东段型及西段A、B型,锡林郭勒高…查看全部>>
- 鼠疫耶尔森菌菌株91001的蛋白质组学初步研究北大核心CSCDCSTPCD摘要：目的建立鼠疫耶尔森菌的蛋白质组学研究方法,获得鼠疫耶尔森菌的基本蛋白质组数据.方法以对人无致病能力的布氏田鼠疫源地菌株91001为研究对象,按照溶解性的不同分别收集菌体蛋白,以3种不同方法(Shotgun-LC-MS-MS,1D-LC-MS-MS和2D-MS)进行分析,将分析数据与基于91001菌株基因组全序列建立的蛋白质理论数据库进行比对,确定91001菌株本实验培养条件下所表达的蛋白组分.结果 Shotgun-LC-MS-MS方法…查看全部>>
- 鼠疫耶尔森菌比较和进化基因组学研究北大核心CSCDCSTPCD