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虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究
北大核心
CSCD
CSTPCD
作者：
周原
梅虎
杨力
周鹏
杨善彬
李志良
发表期刊：
高等学校化学学报 2007年7期
关键词：
虚拟原子探针
分子表面随机采样法
氨基酸侧链表面势能场描述子
苦味二肽
血管舒缓激五肽
定量构效关系
摘要：
考虑药物与蛋白质受体的3类非键作用模式, 利用8类虚拟原子探针和Monte Carlo随机采样技术, 得到了一套新的氨基酸侧链表面静电、立体及疏水势能场(ASSPF)参数. 在此基础上对苦味二肽和血管舒缓激五肽进行了结构表征和QSAR研究, 所建模型复相关系数R2和留一法交互检验复相关系数Q2 -LOOCV分别为0.8457, 0.851和0.7688, 0.7952, 同时分析了肽链不同位置上氨基酸侧链对活性的影响, 取得较好的结果.
