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表达序列标签在寄生虫基因研究中的应用北大核心CSCDCSTPCD
作者：罗洪林黄维义张为宇
发表期刊：中国兽医科技 2004年9期
关键词：表达序列标签寄生虫基因碱基DNA序列
摘要：一个基因组的所有碱基中大约只有2％组成编码蛋白质的那部分基因，因此，测序基因组已不再是一种创建基因目录的有效途径。大量的试验证明，以cDNA的形式进行基因转录产物的大规模测序是了解基因组的首选办法。高通量cDNA测序于1991年由Adams等创始，在构建人脑的cDNA
大豆EST序列长度与SSR特性的关系北大核心CSCDCSTPCD
作者：詹少华盛新颖樊洪泓蔡永萍林毅
发表期刊：大豆科学 2009年2期
关键词：大豆表达序列标签EST-SSR序列长度重复基元
摘要：为了分析大豆EST-SSR的特征和比较其不同长度EST序列中的SSR特性,从NCBI下载了大豆EST序列,应用SSRIT搜索SSR,分析了20 183个无冗余的EST序列,发现了1747个EST序列(8.66%)含有SSR,长度超过400 bp的EST序列含SSR的比例为10.05%,而长度在400 bp以下的EST序列SSR的比例为4.74%.二核苷酸和三核苷酸SSR是大豆EST-SSR的主要类型,分别的60.45%和37.04%,…查看全部>>
斑马鱼ILF2基因的电子克隆分析CSTPCD
作者：金红建王兰州
发表期刊：中国计量学院学报 2003年1期
关键词：ILF2基因表达序列标签电子克隆
摘要：利用电子克隆方法,成功获得了ILF2基因在斑马鱼中的同源基因,为进一步研究斑马鱼ILF2基因功能奠定了基础.斑马鱼ILF2基因cDNA全长为1560bp,含有一个编码387个氨基酸的完整开放阅读框架.比较斑马鱼ILF2基因和人ILF2基因,显示两者编码氨基酸序列相似性为87%,核苷酸序列有72%相同.
单眼视觉剥夺鸽不同脑区tubulin和chs rex b 同源基因的差异表达
作者：宋彩霞吕立夏徐磊杨翠香李学礼王尧
发表期刊：同济大学学报（医学版） 2001年3期
关键词：鸽表达序列标签Northern杂交前脑视盖
摘要：目的　检测tubulin与chs rex b同源基因在左眼视损毁后鸽脑不同脑区的差异表达。方法　以经消减抑制杂交(suppression subtraction hybridization,SSH）方法获得的鸽脑差异表达基因的表达序列标签（expressed sequence tag,EST）为探针，用放射性同位素对其进行标记，藉Northern杂交法分析其mRNA在不同脑区的丰度。结果　与人tubulin有高度同源性及与鸡的c…查看全部>>
人胎脑mRNA的差异显示分析及脑表达新ESTs的分离北大核心CSCD
作者：潘美辉袁建刚陈斌
发表期刊：中国医学科学院学报 1997年2期
关键词：差异显示反转录PCR人胎脑表达序列标签
摘要：应用ｍＲＮＡ差异显示技术分析人胎脑组织不同发育阶段及不同部位基因表达的差异并研究其特异表达的基因。以３个锚定引物Ｏｌｉｇｏ（ｄＴ）１２Ｍ（Ｍ＝Ａ，Ｇ，Ｃ）及２０个随机引物，对脑组织ｍＲＮＡ进行了近５０次差异显示分析，共分离出上百个差示产物。对其中部分产物进行克隆、测序获得了３９个ｃＤＮＡ序列，长度为１００￣５００ｂｐ。其中３４个已被Ｇｅｎｂａｎｋ接受并给予新序列编号。
辣椒疫霉EST-SSRs标记的发掘北大核心CSCDCSTPCD
作者：王子迎袁树忠
发表期刊：扬州大学学报（农业与生命科学版） 2009年2期
关键词：辣椒疫霉表达序列标签SSR标记
摘要：通过对GenBank上发布的55 848条辣椒疫霉EST的鉴定,在328条EST中发现331个SSR.在筛选的EST序列中SSR平均密度为每23.7 kb含有1个SSR.在鉴定的SSR中,三核苷酸重复基元的SSR类型最多,占鉴定总数的59.5%;其次为二核苷酸乖复基元的SSR类型,为39.3%;四核苷酸重复基元的SSR类型最少,为1.2%.设计40对SSR引物对5个辣椒疫霉菌株基因组DNA进行PCR扩增,有27对引物扩增出SSR特征条…查看全部>>
运用数字差异展示方法克隆一个人类新的锌指蛋白基因ZNF474CSCDCSTPCD
作者：周畅师建明肖湘文李麓芸卢光琇
发表期刊：激光生物学报 2006年1期
关键词：数字差异展示方法表达序列标签ZNF474基因
摘要：运用数字差异展示方法,克隆一个与生精相关的睾丸高表达基因.借助公共ESTs数据库,利用DDD软件比较分析各种睾丸文库与其他组织或细胞系文库有差异表达的ESTs,成功克隆到一个在人类睾丸中高表达的新基因.结合实验获得新基因cDNA全长,该基因被国际人类基因命名委员会命名为ZNF474(GeneBank登陆号AY461732).ZNF474的cDNA全长为1 972 bp,定位在5q23.2.通过RT-PCR及测序验证,其开放阅读框的位置…查看全部>>
条斑紫菜丝状孢子体cDNA文库构建及抗病相关基因鉴定北大核心CSCDCSTPCD
作者：杨官品刘永健孙雪沈怀舜许璞张学成
发表期刊：青岛海洋大学学报(自然科学版) 2003年1期
关键词：条斑紫菜cDNA PCR文库cDNA文库表达序列标签抗病基因
摘要：经过微量总RNA抽提、cDNA合成、cDNA扩增和克隆等步骤,构建了微量条斑紫菜丝状孢子体cDNA文库,并进行了小规模表达序列标签分析.从170条标签序列中鉴定出6条抗病相关基因序列.这些序列可用于研制抗病单核苷酸多态性标记,辅助紫菜抗性遗传改良.
东海原甲藻cDNA文库构建及尝试性EST分析北大核心CSCDCSTPCD
作者：张秀芳杨官品刘永建李瑞香朱明远
发表期刊：中国海洋大学学报（自然科学版） 2006年3期
关键词：东海原甲藻cDNA PCR文库表达序列标签
摘要：东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)是中国沿海频繁发生的大规模赤潮的原因种之一,大规模分离鉴定东海原甲藻功能基因是理解东海原甲藻赤潮形成过程和机理的重要基础.取对数生长期藻体,经微量总RNA抽提、cDNA合成、cDNA扩增和克隆等步骤,构建了东海原甲藻cDNA文库并进行了尝试性表达序列标签分析.从含有约5000个转化子的文库中随机取150个测序,获得126条EST序列.经网上BlastN及BlastX分析,共…查看全部>>
日本血吸虫核苷二磷酸激酶基因的获得和序列分析
作者：张愉快肖建华梁瑜曾桥万志刚廖力
发表期刊：南华大学学报（医学版） 2004年1期
关键词：日本血吸虫二磷酸核苷激酶cDNA文库表达序列标签步移法生物信息学
摘要：目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum, Sj)成虫cDNA文库中筛选日本血吸虫新基因,为日本血吸虫病的防治提供药物靶标或候选疫苗.方法筛选日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行DNA测序,再对新基因序列进行步移法测序获取全长cDNA,并利用生物信息学技术对其进行分析.结果获得了1个编码日本血吸虫核苷二磷酸激酶新基因的cDNA序列(AY226980),全长594 bp,编码157个氨基酸,编码蛋白与…查看全部>>

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