基于蜜蜂球囊菌纳米孔测序数据的基因非翻译区延长、SSR位点发掘及未注释基因和转录本鉴定OA北大核心CSCDCSTPCD
Elongation of genic untranslated regions,exploration of SSR loci and identification of unannotated genes and transcripts based on the nanopore sequencing dataset of Ascosphaera apis
[目的]利用已获得的纳米孔长读段测序数据完善现有的蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis参考基因组注释信息,并对未注释的新基因和新转录本进行鉴定和功能注释.[方法]基于已获得的纳米孔长读段测序数据,采用gffcompare软件将蜜蜂球囊菌全长转录本与参考基因组注释的转录本进行比较,进而对参考基因组注释基因的非翻译区(untranslated region,UTR)进行延长.利用TransDecoder软件对蜜蜂球囊菌基因的开放阅读框(open…查看全部>>
杜宇;熊翠玲;郑燕珍;徐国钧;陈大福;郭睿;付中民;祝智威;王杰;冯睿蓉;王秀娜;蒋海宾;范元婵;范小雪
福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学生命科学学院,福州350002福建农林大学,福建省病原真菌与真菌毒素重点实验室,福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002
农业科技
蜜蜂球囊菌长读段测序技术全长转录组基因组蜜蜂白垩病
《昆虫学报》 2020 (11)
1345-1357,13
国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS44-KXJ7)福建省自然科学基金项目(2018J05042)福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158)福建农林大学硕士生导师团队项目(郭睿)福建省病原真菌与真菌毒素重点实验室(福建农林大学)开放课题福建农林大学优秀硕士学位论文资助基金(杜宇)
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