淹水胁迫下鸭茅根系基因差异表达及相关通路分析OA北大核心CSTPCD
近年来我国南方地区洪涝灾害频繁发生,严重制约草牧业的发展。鸭茅作为重要的生态草种和优质牧草,耐淹性较差的特性严重影响其在频繁遭受洪涝区域的推广应用。本研究以国审品种“安巴”鸭茅为研究对象,对淹水胁迫0、8和24 h处理后的幼苗根系生理和转录等进行分析,以探究鸭茅在淹水胁迫下的响应机制。结果显示,淹水胁迫引起鸭茅根系中可溶性糖、可溶性蛋白和丙二醛含量显著增加,相对电导率先减少后显著升高。在淹水胁迫处理8 h后(相较于0 h),鸭茅根系中有5788个差异表达基因,包括上调基因2872个,下调基因2916个。胁迫处理24 h后,鸭茅根系中共有8807个差异表达基因,包括上调基因4123个,下调基因4684个。GO富集显示,这些差异表达基因功能主要涉及多糖代谢、微管结合、纤维素代谢过程、抗氧化反应等。KEGG富集显示,鸭茅根系主要通过苯丙烷生物合成、碳代谢、谷胱甘肽代谢、氨基酸生物合成、淀粉和蔗糖代谢以及糖酵解/糖异生等途径来响应淹水胁迫。进一步分析苯丙烷生物合成、碳代谢、谷胱甘肽代谢通路中的差异表达基因,推测HXK1、HXK2、ADH1、GST和APX2等关键基因在鸭茅响应胁迫中发挥重要作用。MYB、NB-ARC、WRKY、GRAS和AP2等转录因子家族基因在淹水胁迫中表达丰富,可能与鸭茅的耐淹性密切相关。本研究结果为进一步探究鸭茅耐淹的分子机理提供了基础数据,也为后续的鸭茅耐淹性状改良工作提供理论支撑。
曾兵;尚盼盼;沈秉娜;王胤晨;屈明好;袁扬;毕磊;杨兴云;李文文;周晓丽;郑玉倩;郭文强;冯彦龙;曾兵;
西南大学动物科学技术学院,重庆402460贵州省畜牧兽医研究所,贵州贵阳550000西南大学动物科学技术学院,重庆402460 重庆高校草食动物工程研究中心,重庆400715
农业科学
鸭茅淹水胁迫根系转录组差异表达基因代谢通路
《草业学报》 2024 (002)
P.93-111 / 19
贵州林下养蜂提质增效关键技术集成与推广示范研究项目,重庆市现代农业产业技术体系(草食牲畜:CQMAITS202313);西南大学大学生创新训练项目(X202310635206,X202310635042X)资助。
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