分子动力学模拟分析超高压对固液两态多酚氧化酶稳定性的影响OA北大核心CSTPCD
以固态晶体(crystal,C-)、液态(liquid,L-)多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)为对象,采用分子动力学模拟的方法,分析其在常温(298.15 K)常压/高压(0.1~400.0 MPa)条件下分子构象的变化。结果表明:固液两态PPO的空间结构均随压力(0.1~400.0 MPa)增大而变的不稳定;与L-PPO相比,C-PPO对压力更敏感,表现出更高的残基波动,溶剂可及表面积和体积减小,蛋白结构更致密;α-螺旋向无规卷曲过渡,导致氢键数量不稳定,螺旋弹性也降低,整体构象差异明显;活性位点Cu^(2+)位置疏远,残基之间距离发生改变、运动出现随机化,干扰底物催化结合。因此,物理状态和压力改变PPO空间结构、残基运动模式和底物结合范围,影响酶稳定性。因此,PPO状态和压力因素对酶变性程度可排序为:固态>液态,物理状态>压力水平。
李镜浩;梁展鸿;肖更生;徐玉娟;余元善;吴继军;彭健;李璐;程丽娜;
广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所,农业农村部功能食品重点实验室,广东省农产品加工重点实验室,广东广州510610 岭南现代农业科学与技术广东省实验室,广东广州510610 仲恺农业工程学院轻工食品学院,广东广州510631广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所,农业农村部功能食品重点实验室,广东省农产品加工重点实验室,广东广州510610 广东药科大学食品科学学院,广东中山528400仲恺农业工程学院轻工食品学院,广东广州510631广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所,农业农村部功能食品重点实验室,广东省农产品加工重点实验室,广东广州510610 岭南现代农业科学与技术广东省实验室,广东广州510610
轻工业
多酚氧化酶分子动力学模拟物理状态超高压稳定性
《食品科学》 2024 (016)
P.33-44 / 12
岭南现代农业实验室科研项目(NZ2021031);广州市科技计划项目(2023B01J2004);河科社农大专项(2023015);广东省科学技术协会青年科技人才培育计划项目(SKXRC202318);广州市科协青年托举人才项目(QT20220101055);广东省农业科学院“十四五”农业优势产业学科团队项目(202109TD);广东省农业科学院科技人才引进专项资金项目(R2020YJ-YB2001)。
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