一株海洋杆菌属新菌种XAAS-72^(T)的植物促生功能分析及ACC脱氨酶蛋白结构预测OA北大核心CSTPCD
【目的】研究海洋杆菌属新菌种XAAS-72的植物促生功能,挖掘其潜在功能基因。【方法】通过对菌株全基因组测序,分析相关功能基因组成,挖掘ACC脱氨酶合成相关的候选基因,并进行功能预测。【结果】海洋杆菌属新种Pontibacter kalidii XAAS-72菌悬液处理可显著提高盆栽小麦麦苗生长,其基因组长度为5054860 bp,含1个环形质粒,总GC含量为54.52%,注释的基因数目为4391个,编码蛋白数4261个,具有多种抗逆和促生相关基因。其与Pontibacter sp.BAB1700的ACC脱氨酶(1-aminoeyclopropane-1-earboxylate-deaminase)相似度最高为72.48%。该蛋白属于不稳定亲水性蛋白,不具备跨膜结构,且无信号肽结构。【结论】海洋杆菌属新种XAAS-72蕴藏着丰富的抗逆和植物促生相关基因。
王慧楠;朱静;谢文文;何子璇;柏晓玉;朱艳蕾;张志东;
新疆师范大学生命科学学院,乌鲁木齐8300541 新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室,乌鲁木齐830091新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室,乌鲁木齐830091新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室,乌鲁木齐830091 新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐830046新疆师范大学生命科学学院,乌鲁木齐8300541新疆师范大学生命科学学院,乌鲁木齐8300541 新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室,乌鲁木齐830091 新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐830046
农业科学
海洋杆菌属植物促生特性ACC脱氨酶结构预测
《新疆农业科学》 2024 (007)
P.1778-1785 / 8
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目“杰出青年基金”(2022D01E19);新疆农业科学院科技创新重点培育专项(xjkcpy-2022004);新疆农业科学院农业科技创新稳定支持专项(xjnkywdzc-2023005)。
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