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- 球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)叶绿体psaA基因片段的序列分析北大核心CSCD摘要:根据GenBank中检索到的南极棕囊藻(phaeocystis antarctica)psaA基因序列设计psaAL和psaAR引物,对球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)的psaA基因片段进行PCR扩增并测序,获得了629bp的DNA序列.应用Clustal X对球形棕囊藻P1、P2株系和南极棕囊藻的psaA基因片段序列进行比对,结果表明,球形棕囊藻psaA基因片段序列无插入/缺失,核苷酸差异率为3.34%.应用DN…查看全部>>
- RNA二级结构预测SVMs模型研究北大核心CSTPCD摘要:扩展NSSEL标签,对RNA分子中的stem-loop结构和伪结结构进行标记.将RNA分子序列中的碱基编码输入,经过支持向量机(support vector machines,SVMs)模型计算输出相应的结构标记.该模型经过训练后,待预测的RNA分子序列可得到对应的结构标识序列,这些标识序列可通过特定算法,唯一构建包括伪结在内的二级结构.实验结果表明,该算法在可接受的预测精度范围内具有较低的计算复杂度,克服了传统算法计算时间过长,无法…查看全部>>
- 杂色龙虾线粒体基因组全序列的测定与分析北大核心CSCDCSTPCD摘要:为了解杂色龙虾(Panulirus versicolor)线粒体基因组多态位点及遗传变异,对龙虾类的分类研究奠定基础,作者通过常规 PCR步移扩增法获得杂色龙虾线的线粒体基因组全序列,分析了其线粒体基因组的基本特征以及基因排列情况,并结合中国龙虾(Panulirus stimposni)、波纹龙虾(Panulirus homa-rus)线粒体基因组全序列,综合分析了龙虾属线粒体编码基因多态位点及基因变异状况。结果表明:杂色龙虾线粒体基…查看全部>>
- 文法推断RNA二级结构的研究进展CSCDCSTPCD
- 基于词汇化随机文法模型的RNA二级结构预测北大核心CSCDCSTPCD
- 一种基于能量的RNA二级结构预测的动态划分算法北大核心CSCDCSTPCD
- 含伪结的RNA分子二级结构预测CSCDCSTPCD
- 基于茎区的神经网络方法预测RNA二级结构北大核心CSTPCD摘要:RNA二级结构预测是生物信息学的一个重要研究内容.作为预测方法之一的神经网络已被广泛应用于蛋白质结构预测,但在RNA二级结构的应用甚少.本文改进传统预测RNA二级结构的Hopfield神经网络.算法以茎作为网络神经元,通过与相似结构茎区的比对,初始化神经元,并据此修改网络的激励系数.实验把改进后算法与改进前2种算法、Mfold、RNAStructure比较,结果表明本文提出的算法对序列长度较小并且保守性较好的tRNA分子有很好的效果.
- 基于PDB数据库的三个RNA二级结构预测软件评估
- 基于进化神经网络的RNA二级结构预测方法北大核心CSCDCSTPCD