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脊尾白虾3个野生群体ITS1序列分析及其亲缘关系分析北大核心CSCDCSTPCD
作者：马朋刘萍李健
发表期刊：水产学报 2012年8期
关键词：脊尾白虾ITS1遗传多样性系统进化
摘要：对脊尾白虾的莱州湾、海洲湾、象山湾3个野生群体共计62个个体的核糖体RNA转录单元内间隔区ITS1基因片段进行克隆和测序,对序列特点进行分析,并结合GenBank数据库中已有的长臂虾亚科ITS1同源序列虾类进行系统分析.结果显示,脊尾白虾的ITS1序列具有长度多态性,其长度为345～384 bp,62条序列GC的平均含量显著高于AT含量；共检测到79个变异位点,39种单倍型,多态位点比例为21.7％；海洲湾群体遗传多样性指数最高,象山…查看全部>>
中华绒螯蟹(Eriocheir japonica sinensis)内转录间隔区1(ITS1)大小变异的研究北大核心CSCDCSTPCD
作者：唐伯平周开亚宋大祥陈立侨
发表期刊：华东师范大学学报（自然科学版） 2003年3期
关键词：中华绒鳌蟹ITS1大小变异十足目
摘要：在对中华绒鳌蟹(Eriocheir japonica sinensis)(又称河蟹)核糖体DNA内转录间隔区1(ITS1)进行研究时,由于在软甲亚纲中还没有已知序列和5.8S rDNA序列的报道,所以在设计引物时,主要参考了其它节肢动物的序列.用此引物对河蟹的ITS1进行扩增,发现其个体内ITS1如同其他一些无脊椎动物一样,存在其大小变异.为了进一步确证这一发现,首先将得到的所有扩增产物进行测序,然后再扩增出河蟹的整个ITS区并测序.…查看全部>>
扇贝核糖体ITS1和5SrDNA序列的遗传变异及亲缘关系分析北大核心CSCDCSTPCD
作者：廖德杰曹善茂童金苟周颖俞小牧刘阳王潇
发表期刊：水生生物学报 2018年3期
关键词：ITS15SrDNA岩扇贝(Crassadomagigantea)遗传变异亲缘关系
摘要：为探讨引进种岩扇贝(Crassadoma gigantea)及虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)、栉孔扇贝(Chlamys farreri)和海湾扇贝(Argopecten irradians)的遗传变异及其之间的亲缘关系, 研究对4种扇贝的核糖体ITS1序列及5S rDNA序列进行了测定,获得了4种扇贝的ITS1和5S rDNA全序列以及18S rDNA的部分序列,并进行了序列特征、遗传多样性、遗传距离及系统…查看全部>>
毛蚶、泥蚶和魁蚶ITS1核苷酸序列分析北大核心CSCD
作者：孙桂金潘杰刘可春王雪彭维兵何秋霞王思锋
发表期刊：生物技术通报 2011年7期
关键词：泥蚶毛蚶魁蚶ITS1序列分析
摘要：对毛蚶、泥蚶和魁蚶3种贝类的ITS1序列进行PCR扩增、测序及分析,并用Mega3.1软件对其进行系统进化分析.毛蚶、泥蚶和魁蚶的ITS1序列长度分别为424、456和431 bp,3种蚶的479个序列位点中,共有330个保守位点,98个变异位点,94个单突变位点.系统进化分析表明,毛蚶和泥蚶先聚为一支,而后与魁蚶聚为一支.ITS1分析结果显示毛蚶和泥蚶种间的遗传关系较近.
基于rDNA ITSl和ITS2序列的褐飞虱、白背飞虱和灰飞虱的分子鉴定北大核心CSCDCSTPCD
作者：刘玉娣林克剑韩兰芝侯茂林
发表期刊：昆虫学报 2009年11期
关键词：褐飞虱白背飞虱灰飞虱rDNAITS1ITS2特异引物分子鉴定
摘要：本研究测定了褐飞虱 Nilaparvata lugens、白背飞虱 Sogatella furcifera 和灰飞虱Laodelphax striatellus 的rDNA ITSl和ITS2的序列,以探讨这3种稻飞虱的分子鉴定方法.3种飞虱的ITSI和ITS2侧翼区(18S,5.8S和28S)序列相对稳定,但ITS1和ITS2序列在3种飞虱中变异较大.ITS1在所分析的438个位点中可变位点达294个,ITS2在分析的403个位点中…查看全部>>
中国明对虾核糖体ITS1序列分析及其在对虾科系统分析中的应用北大核心CSCDCSTPCD
作者：李玉龙孔晓瑜时伟张艳春
发表期刊：中国海洋大学学报（自然科学版） 2010年3期
关键词：中国明对虾对虾科ITS1长度多态性系统发生关系
摘要：对采自不同群体的5个中国明对虾个体的核糖体RNA转录单元内间隔区1(ITS1)序列特点进行分析,并利用GeneBank数据库中已有的对虾科(Penaeidae)ITS1同源序列对对虾科虾类进行系统分析,探讨ITS1序列在对虾科系统及演化中的应用.结果表明,中国明对虾ITS1序列在个体间和个体内都表现出长度多态性,序列长度范围为637～652 bp,这种长度多态性主要是由于微卫星DNA简单重复序列的重复次数不同所造成.在中国明对虾ITS…查看全部>>
实时荧光定量PCR法快速检测赤潮环状异帽藻北大核心CSCDCSTPCD
作者：石彦红张凤英马凌波
发表期刊：中国水产科学 2010年2期
关键词：环状异帽藻Real-time PCRITS1鉴定定量检测
摘要：以环状异帽藻(Heterocapsa circularisquama)ITS1区为靶序列设计了一对特异性引物,运用Real-time PCR方法,对环状异帽藻进行了定性定量检测.以其他9种赤潮微藻为对照验证其特异性.结果表明,仅含环状异帽藻DNA模板的样品有扩增,其他藻没有检测到扩增信号.以超声波破碎得到的藻液为标准品,所得标准曲线具有高度线性相关,相关系数R~2为0.989.并且可以在30个循环内检测到0.5个细胞.对在不同培养条件…查看全部>>
台湾蠛蠓rDNA-ITS序列测定与分析北大核心CSCDCSTPCD
作者：陈敏肖颖林妙端黄恩炯
发表期刊：中国人兽共患病学报 2018年8期
关键词：台湾蠛蠓rDNAITS1ITS2
摘要：目的探讨rDNA-ITS基因序列在吸血蠓分子鉴定中的应用前景.方法通过PCR扩增获取台湾蠛蠓rDNA-ITS基因,测定分析ITS1和ITS2基因序列,构建系统发育树.结果台湾蠛蠓ITS1和ITS2片段长度分别为310 bp与360 bp,与汤斯维尔铗蠓的同源性最大,分别为71％和92％.系统发育分析显示,基于ITS1、ITS2基因序列的分子鉴定结果与传统形态学鉴定结果一致.结论 rDNA-ITS基因序列可作为蠓科昆虫分子鉴定的分子标记.
基于ITS2和16S rRNA的西施舌群体遗传差异分析北大核心CHSSCDCSCDCSTPCD
作者：孟学平申欣赵娜娜田美曾云陈建安董志国程汉良阎斌伦
发表期刊：生态学报 2013年24期
关键词：西施舌群体ITS116S rRNA遗传差异二级结构
摘要：目前,我国西施舌群体分子遗传差异研究结果存在争议.分析我国南北沿海(9个群体)、与广西北海毗邻的越南(1个群体)西施舌核DNA的内转录间隔区2(ITS2)和线粒体DNA的16S rRNA基因(16S)片段核苷酸序列及其二级结构,为解决争议问题提供分子生物学资料.扩增获得西施舌ITS2片段和16S序列,其长度分别为389-402 bp和306 bp,加之下载序列共147条;序列分析显示,74个ITS2序列共有17种基因型,73个16S序…查看全部>>
11种鲈形目鱼类的核糖体基因GC含量及其与硬骨鱼类的特征比较北大核心CSCDCSTPCD
作者：司李真武宝生孔晓瑜杨敏龚理时伟
发表期刊：中国水产科学 2017年4期
关键词：编码基因间隔区18S5.8SITS1ITS2
摘要：核糖体基因为串联重复多拷贝的基因,包括3个编码基因(18S,5.8S,28S)和两个间隔区ITS1(internal tran-scribed spacer 1)和ITS2(internal transcribed spacer 2).目前,对核糖体基因的相关报道主要集中在个体内不同拷贝间的多态特征,以及其作为分子标记在系统演化关系中的应用,GC含量作为一项非常重要的核苷酸序列指标,而鲜有报道.为了探讨鱼类的核糖体基因GC含量特征以及…查看全部>>

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